Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atf3Q60765 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms