Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Prdm10Q3UTQ7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Prdm10Q3UTQ7 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Prdm10Q3UTQ7 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Prdm10Q3UTQ7 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm10Q3UTQ7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Prdm10Q3UTQ7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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