Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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