Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms