Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms