Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Ipcef1-201ENSMUST00000078070 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Rergl-201ENSMUST00000170650 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Scgb2b1-201ENSMUST00000189372 338 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm45889-201ENSMUST00000209535 1057 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Olfr864-ps1-201ENSMUST00000212664 930 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms