Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms