Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms