Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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