Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms