Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gli1P47806 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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