Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gna11P21278 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gna11P21278 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gna11P21278 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gna11P21278 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gna11P21278 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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Gna11P21278 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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Gna11P21278 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gna11P21278 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gna11P21278 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gna11P21278 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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