Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18529 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18529 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18529 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18529 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18529 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18529 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
P18529 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18529 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18529 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18529 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18529 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18529 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18529 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18529 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18529 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18529 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18529 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18529 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18529 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18529 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18529 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18529 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18529 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18529 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18529 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18529 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18529 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18529 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18529 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18529 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18529 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18529 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18529 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
P18529 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
P18529 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18529 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
P18529 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms