Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms