Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Sp100O35892 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Sp100O35892 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Sp100O35892 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Sp100O35892 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Sp100O35892 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Sp100O35892 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Sp100O35892 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Sp100O35892 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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