Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
2610021A01RikE9Q0Q3 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms