Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms