Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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