Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Usp29Q9ES63 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms