Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Use1Q9CQ56 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Use1Q9CQ56 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Use1Q9CQ56 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Use1Q9CQ56 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Use1Q9CQ56 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Use1Q9CQ56 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Use1Q9CQ56 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Use1Q9CQ56 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Use1Q9CQ56 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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