Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI8

Rtn4r, Reticulon-4 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rQ99PI8 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rtn4rQ99PI8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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