Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Krcc1Q99JT5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
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Krcc1Q99JT5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Krcc1Q99JT5 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
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Krcc1Q99JT5 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Krcc1Q99JT5 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Krcc1Q99JT5 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Krcc1Q99JT5 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Krcc1Q99JT5 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms