Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms