Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Vmn1r200Q8R281 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Vmn1r200Q8R281 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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