Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a45-201ENSMUST00000025732 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Mapkap1-203ENSMUST00000113126 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxc12Q8K5B8 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms