Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms