Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms