Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
JrkQ60976 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
JrkQ60976 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.9 ms