Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Shisa3Q3UPR0 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Shisa3Q3UPR0 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Shisa3Q3UPR0 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Shisa3Q3UPR0 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Shisa3Q3UPR0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Shisa3Q3UPR0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Shisa3Q3UPR0 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Shisa3Q3UPR0 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Shisa3Q3UPR0 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
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Shisa3Q3UPR0 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Shisa3Q3UPR0 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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Shisa3Q3UPR0 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Shisa3Q3UPR0 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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