Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MestQ07646 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms