Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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