Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ufm1P61961 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ufm1P61961 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ufm1P61961 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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