Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms