Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
BgnP28653 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
BgnP28653 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BgnP28653 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BgnP28653 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BgnP28653 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BgnP28653 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BgnP28653 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BgnP28653 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BgnP28653 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms