Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms