Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ccl20O89093 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ccl20O89093 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Ccl20O89093 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ccl20O89093 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ccl20O89093 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ccl20O89093 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ccl20O89093 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ccl20O89093 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ccl20O89093 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ccl20O89093 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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