Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Tmem200cJ3QK46 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Tmem200cJ3QK46 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Tmem200cJ3QK46 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Tmem200cJ3QK46 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Tmem200cJ3QK46 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Tmem200cJ3QK46 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms