Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms