Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms