Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms