Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Hdac5Q9Z2V6 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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Hdac5Q9Z2V6 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Hdac5Q9Z2V6 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms