Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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