Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0S3

Mmp17, Matrix metalloproteinase-17, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp17Q9R0S3 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp17Q9R0S3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp17Q9R0S3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp17Q9R0S3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 362.6 ms