Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL16

Isg20, Interferon-stimulated gene 20 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Isg20Q9JL16 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Isg20Q9JL16 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms