Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms