Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Srp19Q9D7A6 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms