Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fndc8Q9D2H8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms