Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem53Q9D0Z3 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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