Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rfc5Q9D0F6 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rfc5Q9D0F6 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rfc5Q9D0F6 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rfc5Q9D0F6 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rfc5Q9D0F6 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rfc5Q9D0F6 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rfc5Q9D0F6 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rfc5Q9D0F6 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Rfc5Q9D0F6 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Rfc5Q9D0F6 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Rfc5Q9D0F6 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rfc5Q9D0F6 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rfc5Q9D0F6 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rfc5Q9D0F6 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Rfc5Q9D0F6 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Rfc5Q9D0F6 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Rfc5Q9D0F6 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rfc5Q9D0F6 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rfc5Q9D0F6 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rfc5Q9D0F6 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rfc5Q9D0F6 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rfc5Q9D0F6 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rfc5Q9D0F6 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rfc5Q9D0F6 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rfc5Q9D0F6 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rfc5Q9D0F6 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rfc5Q9D0F6 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rfc5Q9D0F6 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rfc5Q9D0F6 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rfc5Q9D0F6 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rfc5Q9D0F6 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rfc5Q9D0F6 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rfc5Q9D0F6 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rfc5Q9D0F6 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rfc5Q9D0F6 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms