Protein–RNA interactions for Protein: Q99M28

Rnps1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1Q99M28 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnps1Q99M28 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms